Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms