Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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