Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FXNQ16595 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FXNQ16595 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FXNQ16595 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms