Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC6Q16204 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC6Q16204 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms