Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNIP1Q15025 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms