Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SSPNQ14714 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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