Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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