Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms