Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nedd1P33215 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms