Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLD1P28340 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms