Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMD1P17707 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms