Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC24AO95486 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms