Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MATN4O95460 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MATN4O95460 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MATN4O95460 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms