Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms