Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
KRTAP1-5Q9BYS1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.6 ms