Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC8Q9BY41 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC8Q9BY41 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC8Q9BY41 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC8Q9BY41 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC8Q9BY41 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC8Q9BY41 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC8Q9BY41 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDAC8Q9BY41 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HDAC8Q9BY41 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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HDAC8Q9BY41 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDAC8Q9BY41 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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