Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRPF18Q99633 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms