Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAMP4Q969E2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms