Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC112Q8NEF3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms