Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMPD1Q5SYB0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms