Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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