Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP107P57740 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms