Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC11A1P49279 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms