Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GJA4P35212 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms