Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNGA1P29973 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms