Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRMP28827 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRMP28827 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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