Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CDH16O75309 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDH16O75309 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDH16O75309 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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