Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HOXA2O43364 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HOXA2O43364 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HOXA2O43364 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HOXA2O43364 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HOXA2O43364 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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HOXA2O43364 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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HOXA2O43364 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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HOXA2O43364 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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HOXA2O43364 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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HOXA2O43364 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA2O43364 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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