Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CadB2RQC6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CadB2RQC6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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