Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SH3BP4Q9P0V3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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