Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIRIP3Q9BW71 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIRIP3Q9BW71 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms