Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FGD4Q96M96 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.6 ms