Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms