Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms