Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ITGA7Q13683 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA7Q13683 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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