Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 FGL1-201ENST00000381840 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC104794.2-201ENST00000567540 1572 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC055758.2-201ENST00000495382 799 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TMEM161B-207ENST00000509387 963 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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