Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GRIK2Q13002 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIK2Q13002 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms