Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
COPB2P35606 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
COPB2P35606 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COPB2P35606 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms