Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMO2P25791 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMO2P25791 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMO2P25791 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMO2P25791 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMO2P25791 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMO2P25791 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMO2P25791 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMO2P25791 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMO2P25791 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMO2P25791 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms