Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC166P0CW27 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC166P0CW27 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms