Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LRRTM2O43300 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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