Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms