Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hdgfl3Q9JMG7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hdgfl3Q9JMG7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hdgfl3Q9JMG7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms