Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Tuba8Q9JJZ2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba8Q9JJZ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Tuba8Q9JJZ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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Tuba8Q9JJZ2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Tuba8Q9JJZ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tuba8Q9JJZ2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Tuba8Q9JJZ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Tuba8Q9JJZ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Tuba8Q9JJZ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tuba8Q9JJZ2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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