Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930519G04RikQ9CPT7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930519G04RikQ9CPT7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930519G04RikQ9CPT7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930519G04RikQ9CPT7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930519G04RikQ9CPT7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930519G04RikQ9CPT7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930519G04RikQ9CPT7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930519G04RikQ9CPT7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms