Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmed9Q99KF1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmed9Q99KF1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tmed9Q99KF1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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