Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Def8Q99J78 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Def8Q99J78 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms