Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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Slc8b1Q925Q3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc8b1Q925Q3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Slc8b1Q925Q3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc8b1Q925Q3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc8b1Q925Q3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms