Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC45.76■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC45.75■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC45.75■■■■■ 4.92
RB1CC1Q8TDY2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
RB1CC1Q8TDY2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC45.64■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
RB1CC1Q8TDY2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC45.62■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC45.61■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC45.59■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC45.57■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC45.57■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.89
RB1CC1Q8TDY2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC45.56■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RB1CC1Q8TDY2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms