Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkn3Q8K045 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pkn3Q8K045 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms